Nguyên nhân làm cho tính trạng do gen nằm trong tế bào chất di truyền theo một cách thức rất đặc biệt là:
Tính trạng đo gen nằm trong tế bào chất di truyền theo dòng mẹ và không tuân theo các qui luật di truyền của gen trong tế bào chất như: phân li, phân li độc lập, hoán vị gen...Vì trong quá trình thụ tinh hợp tử chủ yếu nhận tế bào chất từ tế bào trứng mà không nhận từ tinh trùng; mặt khác sự phân chia tế bào chất cho các tế bào con cũng không đồng đều và không theo qui luật nhất định.